治疗原则以全身治疗为主结合局部处理常用药物有：
①盐酸吐根碱（emetini hydrochloridium）对阿米巴滋养体的杀灭作用最强但对包囊的作用不肯定毒性大对心肾功能不全年老体弱患者及孕妇等禁用常用剂量为每天0.06g（1mg/kg）深部肌肉注射连续6～9天为1疗程重复治疗要在20～30天以后；
②卡巴砷每次0.25g每日2次10天为1疗程；③灭滴灵200～400mg每日3次10～14天为1疗程；
④鸦胆子（functus bruceae）对急性阿米巴有效也可用于慢性患者及带菌者口服鸦胆子仁10～15粒每日3次7天为1疗程局部治疗：可将上述药物制成溶液作阴道冲洗或制成粉剂及栓剂置入阴道每日1次共7～10天为1疗程
要预防阿米巴性阴道炎 ，首先要注意个人卫生及饮食卫生 ，饭前便后要洗手其次要保持外阴清洁 ，防止粪便继续污染外阴及阴道 ，以免沾染上阿米巴滋养体 ；要注意消毒隔离 ，禁止性生活发病后 ，要及时诊治
